جداسازی آنالوگ های ژن های مقاومت به بیماری(rgas) در سیب زمینی با استفاده از روش

نویسندگان

سارا دژستان

s. dezhsetan university of tabriz, tabeiz, iranدانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز سید ابوالقاسم محمدی

s. a. mohammadi university of tabriz, tabriz, iranدانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز محمد مقدم

m. moghaddam university of tabriz, tabriz, iranدانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز سعید اهری زاد

s. aharizah university of tabriz, tabriz, iranدانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز ژاک اچ. وسن

چکیده

استفاده از ارقام مقاوم یکی از راه کارهای اصلی کاهش خسارت ناشی از تنش های زیستی در گیاهان است. لازمه تولید چنین ارقامی شناسایی، جداسازی و مکان یابی ژن های مقاومت به بیماری است. در این پژوهش، برای جداسازی آنالوگ های ژن های مقاومت به بیماری در سیب زمینی از روش motif directed profiling (mdp) استفاده شد. بدین منظور، هفت آغازگر دژنره طراحی شده براساس دامنه حفاظت شده tir ژن های مقاومت به بیماری گیاهی برای تکثیر آنالوگ های ژن های مقاومت به بیماری در 46 نتاج f1 حاصل از تلاقی دو والد دیپلویید هتروزیگوت sh83-92-488(sh) و rh89-039-16(rh) با حداکثر نوترکیبی مورداستفاده قرار گرفت. در مجموع 454 نشانگر چندشکل حاصل شد که با استفاده از نقشه پیوستگی aflp جمعیت متشکل از 10000 نشانگر، مکان یابی شدند. برای شناسایی rgaها تعدادی از نوارها جداسازی و توالی یابی شدند که 11/66 درصد آن ها (160 نوار) تشابه معنی دار با ژن های مقاومت شناخته شده و rgaها داشتند و اغلب این rgaها در نواحی ژنومی سیب زمینی و گوجه فرنگی دارای خوشه های rga مکان یابی شدند. نقشه پیوستگی این rgaها در ارتباط با نقشه پیوستگی فوق اشباع این جمعیت با 10000 نشانگر aflp نشان داد که اغلب این rgaها در خوشه ها یا زیرخوشه های جدید یا موجود در نقشه گروه بندی شدند. تعداد 117 نشانگر در مکان های منطبق با خوشه های ژن های مقاومت روی کروموزوم های 5، 6، 9 و 11 و همچنین 15 نشانگر در جایگاه تقریبی مکان های ژنی کمّی مقاومت موجود در کروموزوم های 1، 2، 4 و 7 مکان یابی شدند. اکثریت این rgaها، معرف توالی های rga جدید بودند. نتایج حاصل از این پژوهش می تواند در مکان یابی ژن های مقاومت منفرد و مکان های کمی مقاومت به بیماری ها مورداستفاده قرار گیرد

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

شناسایی آنالوگ های ژن های مقاومت به بیماری (rgas) در جمعیت f۱ درحال تفرق سیب زمینی با استفاده از تکنیک nbs profiling

به منظور شناسایی و جداسازی آنالوگ های ژن های مقاومت (rgas) در سیب زمینی، 46 ژنوتیپ از جمعیت f1 درحال تفرق دیپلوئید rh×sh با حداکثر نوترکیبی با استفاده از تکنیک nbs profiling در آزمایشگاه ژنومیکس دانشگاه واگنینگن هلند مورد ارزیابی قرار گرفتند. با استفاده از پنج آغازگر دژنره طراحی شده براساس موتیف های حفاظت شده دامنه nbs، در مجموع 187 نشانگر چندشکل تولید شد که در ارتباط با نقشه aflp جمعیت متشکل ا...

متن کامل

اثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین

Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...

متن کامل

اثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین

Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...

متن کامل

شناسایی ژن مقاومت به ویروس Y در ژنوتیپ های سیب زمینی (Solanum tuberosum L) و ارتباط آن با عملکرد غده قابل فروش

ژن Rysto که منشأ آن گونه وحشی Solanum stoloniferum است و موجب ایمنی به ویروس Yی سیب­زمینی می ­شود در 21 کلون و رقم (ژنوتیپ) سیب ­زمینی شناسایی شد و ژنوتیپ­ ها از لحاظ برخی صفات زراعی بررسی شدند. برای شناسایی این ژن مقاومت و عملکرد غده ژنوتیپ ­ها، پنج آزمایش اجرا شدند. در آزمایش اول 320 ژنوتیپ در مزرعه کشت شدند و براساس علایم ظاهری بیماری (با مشاهده علایم موزائیک در برگ­ ها) تعداد 55 کلون و رقم ...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
به نژادی نهال و بذر

جلد ۲۶، شماره ۱، صفحات ۱۰۵-۱۲۳

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023